La Seo de Urgell limita al norte con les Valls de Valira; al noreste con Estamariu; al sureste con Alás Serch; al sur con Ribera d´Urgellet; y al oeste con Montferrer i Castellbò.
La Seo d´Urgell se extiende al centro de la planicie o ribera de la Seo, formada por el río Segre con su confluencia con el río Valira. La cañada, donde está situado el municipio, es producto del hundimiento de una dovela pirenaica, terraplenada posteriormente por depósitos lacustres.
La ribera de la Seo está rodeada de altas montañas y cordilleras, de las cuales la más vistosa es la Sierra del Cadí, coronada de roca blanca, importante escarpado de falla que limita por el sur la fosa tectónica.