Abierta al océano, la ciudad vivió mucho tiempo de la pesca y del puerto. Su prosperidad fue particularmente importante en los siglos XVI y XVII, período durante el cual conoció un momento cumbre con ocasión de la boda de Luis XIV y de la infanta María Teresa en 1660. De finales del siglo XIX hasta la actualidad, San Juan de Luz se ha convertido en un lugar turístico de renombre cuyos habitantes han sabido preservar su patrimonio a la vez que han incorporado los avances del siglo XX.

En el interior, la iglesia está constituida por una nave única coronada por tres pisos con unas magníficas galerías de madera. La pieza más destacable es sin duda su gran retablo del siglo XVII. Sin lugar a dudas es el más bello y el más espectacular de todo el País Vasco. Diez peldaños conducen a él, acotados por una barandilla de hierro forjado, negra y dorada. Por encima y hasta la bóveda hay una profusión de estatuas rutilantes. Bajo la bóveda se balancea como exvoto un barco que lleva las armas de la emperatriz Eugenia, ofrecido en reconocimiento de un naufragio que se evitó milagrosamente en la bahía. Con una acústica impresionante, la iglesia de Saint Jean-Baptiste sirve de marco a los conciertos y actuaciones durante los que se puede apreciar la calidad de la caja de órganos del siglo XVII.